人體攝入的食物都是在腸道中大量細菌的幫助下被消化的，消化完畢后，這些細菌也被排出體外。
為研究人類腸道細菌生態系統是如何變化的，研究人員分析了在美國猶他州和墨西哥發現的糞化石或保存下來的古代糞便DNA。相關研究結果發表于5月12日出版的《自然》。
這些數據讓科學家首次對古代腸道細菌群落有了很好的了解。斯坦福大學生物學家Justin Sonnenburg說：“這些古糞便相當于一臺時間機器。”
論文通訊作者、哈佛醫學院微生物學家Aleksandar Kostic表示，在過去的1000年里，人類腸道經歷了一次“滅絕事件”，失去了幾十個細菌物種，多樣性顯著減少。
既往研究以狩獵采集者和牧民的腸道細菌作為古代微生物群的代表，發現這些人群體內的微生物多樣性遠超工業社會的現代人。研究人員認為，腸道細菌的低多樣性與“文明疾病”(如糖尿病、肥胖和過敏)的高發病率有關。但目前還不清楚今天的非工業人群與古代人類有多少共同之處。
“我們希望看看現代腸道微生物群是什么時候發生變化的，以及是由什么原因造成的——是食物加工問題，還是抗生素或衛生問題。”論文合著者、哈佛大學遺傳學家Christina Warinner說。
研究人員分析了墨西哥和美國西南部3個巖石掩體中由于干燥和溫度穩定而保存下來的8塊古代糞化石，并對其DNA進行了分析。通過與已知的同哺乳動物腸道相關的細菌序列對比，他們從中挑出了古老的腸道菌種。
這181個古老的基因組可能來自人類腸道菌群，其中許多類似于今天在非工業人群腸道樣本中發現的菌群，包括與高纖維飲食相關的菌種。研究人員在樣本中還發現了少量食物基因序列，證實了早期北美農民的典型食物包括玉米和豆類。
此外，古代微生物種群與現代微生物群也有所不同，例如缺乏抗生素耐藥性標記。而且前者明顯更多樣化，包括幾十種未知的菌種。Kostic表示，僅在這8個樣本中，他們就發現了38%的新菌種。
來自古糞便的數據顯示，當今地球上，沒有任何人的微生物群能幸免于“滅絕”變化。麻省理工學院遺傳學家Mathieu Groussin說：“非工業人群及其體內的微生物群，不應該被認為是我們祖先的替代品。”
“這些發現還表明，我們失去了很多微生物‘助手’，而我們的身體可能沒有時間來適應。”Sonnenburg表示，“這項研究提供了一個檢查我們失去了哪些菌種的黃金標準。”
標簽： 腸道細菌
